Grad Zagreb uspješno surađuje s organizacijama civilnog društva koje se bave integracijom migranata i izbjeglica u hrvatsko društvo. Organizacije provode mjere i aktivnosti iz Akcijskog plana prema niže navedenim područjima, a bave se i širim spektrom aktivnosti te pružaju podršku i pomoć migrantima i izbjeglicama iz prve ruke. Potaknuti uspješnom dosadašnjom suradnjom i zajedničkim projektima, organizacije civilnog društva imat će važnu ulogu i u djelovanju Centra dobrodošlice, kroz pomoć u svakodnevnim poslovima, ali i provođenjem radionica i predavanja u prostorijama Centra dobrodošlice.
Isusovačka služba za izbjeglice - tečaj hrvatskog jezika, usluge prevođenja i kulturne medijacije, upoznavanje s kulturom i tradicijom u RH, senzibiliziranje javnosti o integraciji
Centar za kulturu dijaloga - tečaj hrvatskog jezika, usluge prevođenja i kulturne medijacije, upoznavanje s kulturom i tradicijom u RH, senzibiliziranje javnosti o integraciji, informatičke radionice (izrada životopisa, motivacijskog pisma), jačanje kompetencija službenika gradske uprave
Centar za mirovne studije - upoznavanje s kulturom i tradicijom u RH, senzibiliziranje javnosti o integraciji, jačanje kompetencija službenika gradske uprave
Bez granica - tečaj hrvatskog jezika, upoznavanje s kulturom i tradicijom u RH, senzibiliziranje javnosti o integraciji, informatičke radionice (izrada životopisa, motivacijskog pisma)
Inicijativa centar za edukaciju - tečaj hrvatskog jezika, upoznavanje s kulturom i tradicijom u RH, informatičke radionice (izrada životopisa, motivacijskog pisma)
Rehabilitacijski centar za stres i traumu - tečaj hrvatskog jezika, usluge prevođenja i kulturne medijacije, osnaživanje tražiteljica međunarodne zaštite, upoznavanje s kulturom i tradicijom u RH
Zemljani - Are You Syrious - tečaj hrvatskog jezika, usluge prevođenja i kulturne medijacije, upoznavanje s kulturom i tradicijom u RH, informatičke radionice (izrada životopisa, motivacijskog pisma)
Centar za kazalište potlačenih Pokaz - tečaj hrvatskog jezika
Živi atelje Dajht Kralj – osnaživanje tražiteljica međunarodne zaštite
Hrvatski pravni centar - jačanje kompetencija službenika gradske uprave
Médicins du monde ASBL – Dokters van de wereld VZW – jačanje kompetencija službenika gradske uprave
Iskra - osnaživanje tražiteljica međunarodne zaštite, upoznavanje s kulturom i tradicijom u RH
Pravna klinika – besplatno pravno savjetovanje